Ata Bioinfo

Improving quality of a pipeline

Pipelines

This task is aimed to take a pipeline maked in qsub format and rebuild it into nextflow, make a virtual environment and a Docker container to run this pipeline. To pursue…

Rna-seq

Transcriptoma

O sequênciamento de RNA é uma das melhores técnicas de análise de trascriptoma, junto com single-cell, superaram as limitações dos microarrays. Ela é baseada em um processo…

Carlos Daniel M Duarte

Sequênciamento de teceira geração, PacBIO

Sequenciamento

A tecnologia da pacbio se baseia em SMRT (Single-Molecule Real Time) no qual é possiível observar a adição de nucleotideos em tempo real, pois é usado uma enzima modificada…

Sequenciamento de primeira geração

Sequenciamento

A tecnologia é baseada em dideox nucleotídeo nucleotídeo o qual provoca o travamento da sinstese da fita no momento o qual ele é adicionado. gerando assim, vários fragmentos…

Sequênciamento de terceira geração / Nanopore

Sequenciamento

O sequênciamento baseado em Nanoporos é um tipo de sequênciamento o qual um ácido nucléico passa por uma proteina acoplada em uma membrana a qual no seu lado exteior(cis)…

Fundamentos do NGS

Sequenciamento

texto baseado neste video do eduardo castan

iris

testes

python

Este é um aquivo que serivá para práticar o uso do vim e do quarto desta vez com um codigo em python, o qual será mais complexo do que o anterior

Teste com condigo em python

testes

python

daniel@DESKTOP-J3U8KOO:~/ATA_bioinfo_2024$ quarto preview Terminating existing preview server….DONE